세계에서의 소실 - 타케시가 카멜롯에서의 특훈을 끝내고 자택에 돌아오자 안에서 겟코가 나온다. 겟코의 오른손이나 손에 쥔 트와일라이트는 튄 피로 물들어 있었는데...

펜드래건의 결전 - 쿠루미를 구하기 위해 카멜롯에서 훈련을 계속하는 타케시. 그 무렵 쿠루미는 고스트 트레일러의 본부의 한 방에서 겟코와 대치하고 있었다. 한순간의 틈을 찔러 방에서 도망친 쿠루미. 그런데 술래잡기마냥 트와일라이트를 들고 겟코가 쫓아온다.

사라진 경계 - 고스트트레일러였던 겟코에게 쿠루미와 트와일라이트를 빼앗긴 타케시는 심한 상처를 입고 키사키 에나 일행에게 구조된다. 현재 무사했던 학생은 위저드 블레스의 본부에 모여 있다고 하는데, 타케시의 몸이 본래 상태로 돌아갈 때까지는 여기서 신세지게 된다.

붕괴의 서곡 - 계속 잠들어 있던 고스트 트레일러의 우두머리, 류센지 카즈마가 깨어나게 되자 제2차 마법대전의 막이 오른다. 그리고 스바루 마법학원에 붉은 용, 와이번이 나타나 학원을 혼란에 빠뜨리는데...

위저드 블레스의 어둠 - 4월이 되어 스바루 마법학원은 신입생들로 북적이고 있었다. 그 중에는 이다의 여동생 후타바의 모습도. 후타바는 이다와의 해프닝이 원인으로 마법사가 되어버렸다던가. 또 신입생 중에는 타케시의 동생 겟코의 모습도 있었다, 마법사가 된 설명을 요구해도 머잖아라며 얼버무리는 겟코. 그런 어느 날 생각지도 못한 일이 일어난다.

마검의 비밀 - 매일 밤 악몽을 꾸는 타케시. 어느 날 현기증으로 휘청거리다 그대로 쓰러져 버린다. 나나미의 말에 의하면 심한 과로와 수면부족이라고 하는데. 보건실에서 쉬고 있던 타케시의 주변에 이상 현상이 일어난다.

격투와 탈환 - 계통마법시험에서 상위로 남은 타케시 일행은 약속대로 츠가나시 탈환작전에 동행하게 된다. 학원장 모모카에 의해 데려가진 장소에는 와시즈와 츠가나시의 모습이 있었다. 모모카는 와시즈와, 타케시 일행은 츠가나시와, 그야말로 각자의 싸움이 시작되려 하고 있었는데...

마법시험과 겨울방학 - 계통마법일제시험의 성적에 따라 무이의 오빠인 츠가나시 탈환작전에의 참가를 정식으로 인정받게 된 타케시 일행. 시험회장의 각 장소에는 계통마법마다 나눠진 시험이 행해지고 있었다. 타케시가 치르는 회피마법의 시험은 각종 장애를 회피하여 골 지점인 건물을 목표로 하는 것. 그 시험 와중에 타케시는 생각지도 못한 인물과 조우하는데...

붕괴 세계의 무이와 츠가나시 - 마력을 컨트롤하기 위해 아침 연습을 하고 있는 타케시와 이다. 그곳에 쿠루미가 찾아와 무이가 어제부터 기숙사에 돌아오지 않는다는 사실을 전한다. 방에 남겨진 지도로부터 혼자서 오빠인 츠가나시를 데리러 갔음을 눈치챈 타케시는 무이를 찾으러 가고 싶다는 말을 꺼낸다.

마법학원과 연애점 - 마법 공부를 하기 위해 스바루 마법학원에 편입한 타케시 일행. 어떤 날의 수업 전, 무이는 영어교사 바이올렛에게서 점술 티켓을 받고, 이를 쿠루미한테도 나눠 준다. 아무래도 적중률 97%를 자랑하는 인기 점술사로 연애점이 특기라는 듯 하다. 무이와 만난 이후, 타케시의 변화에 느끼는 바가 있던 쿠루미는 혼자서 점술사에게 가게 되는데...

또 하나의 세계 - 무이의 안내로 또 하나의 세계인 붕괴 세계로 들어가게 된 타케시 일행. 그곳에서 그들은 과거에 있었던 마법대전과 세계의 현상태에 대한 설명을 듣는다. 마력을 지니게 된 타케시 일행에게 스바루 학원의 학원장인 시죠 모모카는 마력을 잃고 원래 살던 현존 세계로 돌아갈지, 아니면 마법사로서 붕괴 세계에 남을지를 선택하라고 하는데...

한여름의 마법소녀 - 어떤 여름날의 일. 나나세 타케시는 부실동에서 본적 없는 교복을 입은 소녀 아이바 무이가 쓰러져 있는 것을 목격한다. 의식을 잃은 무이를 보살피기 위해 보건실까지 옮긴 타케시였지만, 의식이 돌아온 무이에게 수상한 사람으로 오해받고 만다. 서로의 입장차이인지, 대화가 성립되지 않는 와중에 어찌저찌 오해는 풀게 된 차에, 수상한 집단이 나타나 무이를 데려가려고 하는데...