고토와의 싸움도 끝나고 안정을 되찾은 신이치. 하지만 오른쪽이가 작별을 고하면서 상실감을 느끼게 된다. 그러던 중 살인마 우라가미가 나타나서 위협을 하는데…

자포자기해 고토와 싸우려고 나선 신이치. 하지만 예상대로 고토에게 크게 몰려 생사의 기로에 서게 된다. 그러던 중 고토의 허점을 찾아내고 전세는 크게 뒤바뀌게 된다.

동 후쿠야마 시청에서 기생생물들을 처리해 나가는 야마기시. 하지만 본격적으로 나선 고토에게 밀려 부대 전원을 잃고 본인의 목숨도 잃고 만다. 신이치는 그 모습을 보고 고토에 대해 공포를 느끼는데...

동 후쿠야마 시청에서 시작된 기생생물 제거 작전. 인간의 DNA를 식별할 수 있는 센서로 기생생물을 골라내는 데 성공하지만 텔레파시로 상황을 눈치챈 기생생물들은 건물 안에서 움직이지 않는다. 결국 군대는 시청 건물 안으로 난입하고 기생생물들을 몰아붙이기 시작한다.

기생생물을 구분하는 능력을 가늠하기 위해 연쇄살인귀 우라가미와 만나게 된 신이치. 신이치는 아기를 보호하던 타무라 레이코와 살인귀 우라가미를 비교하며 혼란을 느낀다. 한편 히라마 형사가 주도하는 기생생물 처리 작전이 동 후쿠야마 시청에서 시작된다.

공원에서 타무라 레이코와 마주친 신이치. 타무라 레이코가 자신이 연구를 하면서 깨닫게 된 것들을 신이치에게 털어놓던 와중 경찰이 들이닥친다. 경찰은 타무라를 기생생물로 확신하고 총격을 가하고, 타무라는 신이치에게 아기를 부탁하고 죽는다.

타무라 레이코에게 잠재적인 위험을 느끼고 제거에 나선 3마리의 기생생물들. 하지만 오히려 레이코에게 반격을 당해 전멸하고 만다. 하지만 타무라 레이코는 집에 귀가한 직후 탐정이 아이를 납치했음을 깨닫게 된다.

갑자기 나타난 기생생물 '미키'를 피해 움직인 신이치. 하지만 미키는 택시를 타는 등 끝까지 쫓아온다. 미키는 한 몸에 3마리가 기생한 강한 기생생물이지만 잘 넘어지고 어처구니 없는 실수를 하는 등 이상한 데가 있다. 신이치는 오른쪽이와의 협력으로 미키를 해치우지만 그 후에 더 놀라운 사실을 알게 되는데…

탐정에게 도움 요청을 받고 나섰다가 히로카와 집단에서 만든 식당을 발견한 신이치. 신이치는 그동안 기생생물의 살인에 눈 감은 자신을 반성하고 앞으로는 달라지기로 결심한다. 그러나 히로카와 집단은 신이치를 위험인물로 규정하고 자객을 보내는데…

탐정에게 정체를 들키고 고심하던 중 신이치는 우다의 도움을 받아 탐정을 붙잡는다. 탐정에게 사정을 이야기하고 눈 감아주기를 요청하지만 탐정은 이상론을 들먹이며 신이치에게 세상에 나서기를 주장한다. 그 이후 타미야 료코의 연락을 받고 그녀를 만나러 가는데…

카나가 살해당하고 신이치 스스로도 자신의 감정 상태에에 회의를 느끼고 주변에서도 의문을 갖는 사람이 나타난다. 타미야 료코는 신이치의 관찰을 위해 사설탐정에게 의뢰하고 그는 뒤를 쫓다 오른쪽이를 목격한다. 사설탐정에게 목격당하고 불안함이 극에 달한 신이치는 사토미에게 모든 것을 털어놓으려 하지만 오른쪽이 때문에 포기한다.

시장 선거운동을 하는 기생생물들을 보고 위협을 느낀 신이치. 그 와중 카나는 기생생물들이 내는 신호를 신이치의 신호로 착각하고 운명이라 느낀다. 그런 카나를 보호하고자 신이치는 그 신호를 따라가지 말라고 계속 설득하지만 카나는 신이치를 좋아하는 마음에 듣지를 않는다.

실험이라는 미명하에 폭력배를 다수 몰살시키는 기생생물. 그 기생생물은 시장 선거운동에도 참여하고 있었다. 카나를 만나러 나갔다가 유세 현장을 목격한 신이치는 당황하고…

유코에게 정체를 들키고 본성을 드러낸 시마다. 하지만 유코가 던진 화학물질에 치명타를 받고 혼란 상태에 빠져 무차별 학살을 시작한다. 이에 신이치는 위험에 빠진 사토미를 구하고 시마다를 해치우려고 한다.

카나 때문에 미츠오와 충돌한 시마다. 미츠오는 분한 마음에 패거리를 끌고와 시비를 건다. 한편 신이치는 시마다가 누군가 해치지 않을까 하는 걱정에 시마다를 견제한다. 하지만 자꾸 달라진 자신의 모습에 스트레스를 받는데…

오른쪽이를 몸에 받아들이고 기생생물처럼 변해버린 신이치. 사토미는 그런 신이치를 보고 불안해한다. 한편 타미야 료코가 보낸 시마다 히데오가 전학생으로 나타나면서 신이치는 다시 긴장하는데…

엄마를 해친 기생생물을 찾아나섰다가 '우다'와 마주친 신이치. 우다는 신이치와 마찬가지로 기생생물에게 일부만 몸을 뺏긴 사람이었다. 같은 경험을 한 동지를 만나 회포를 푸는 두 사람. 우다는 신이치의 이야기를 듣고 도와주겠다고 나서고, 다음 날 그 기생생물이 나타났다고 연락을 해온다.

엄마의 몸을 뺏은 기생생물에게 심장을 찔린 신이치. 오른쪽이는 그런 신이치를 살리기 위해 스스로 심장이 되는 등 다방면으로 노력한다. 정신을 차린 신이치는 아버지가 병원에 입원했다는 연락을 받고 찾아가지만 아버지는 정신적 충격으로 엄마를 해친 기생생물을 부정하고, 신이치는 만약을 대비해 병원 주변에서 경비를 선다.

신이치는 자신이 기생생물과 섞여있다는 타미야 료코의 말에 신경이 쓰이고, 그 말에 반발하듯 남의 싸움에 끼어드는 등 인간다움을 추구한다. 그 와중 여행을 떠난 신이치의 부모님은 여성을 몸을 찾아다니던 기생생물과 마주치는데…

오른쪽이와의 역할 분담으로 A를 처리한 신이치. 하지만 기생생물에 대한 위협을 계속 느낀다. 그러던 중 타미야 료코는 미혼의 몸으로 임신한 탓에 학교에서 추궁을 당하고, 결국 신분을 바꾸겠다는 결심을 하게 된다. 한편 신이치는 부모님이 여행을 떠난다고 하자 기생생물에 대한 걱정으로 심하게 반대하는데…