카논은 이바라 일행을 쫓기위해 파괴된 철거미에 자신의 능력인 전기를 이용하여 재가동 시킨다. 이바라는 무리해서 자신의 생명까지 위태롭게 하는 오즈 자매를 구하려하지만 그녀들은 쉽게 물러서지 않는데…

양동반은 전철역에서 수리반을 기다리지만 오즈 자매의 탐지 능력으로 인해 작전이 탈로나고 공격당게 된다. 하지만 하루토가 준비해 두었던 트랩으로 무사히 전철 탑승에 성공하고 남겨진 제1사단의 병사들과 함께 방사능 존으로 부터 탈출을 시도하는데…

제1사단은 하얀망토를 구하기 위해 비밀병기인 철거미를 기동시키고 나루세 일행은 철거미를 쓰러트리기 위해 노력한다. 오즈자매는 이런 나루세 일행을 계속해서 방해하고 아오이를 죽이려 하지만 아오이의 각성으로 실패하고 마는데…

나루세 일행은 바람에 실려오는 방사능을 피하기 위해 양동작전을 개시한다. 정비반은 전철을 수리하고 양동반은 전철을 수리하는 시간동안 오즈자매와 제1사단을 한곳에 붙잡아둔다. 과연 양동작전이 무사히 성공할수 있을지…

바람으로 인해 존에 갇혀버린 나루세 일행은 존에서 벗어나기 위해 전철을 이용한 탈출 작전을 세운다. 정비반과 양동반으로 나뉘어 전철의 수리와 오즈자매의 접근을 막기위한 준비를 하게되고 출산에 대비하여 나고야에 있는 아야메 할머니도 작전에 가세하게 되는데…

구 수도 중심지를 향해 가던 나루세 일행은 오즈자매가 길가에 둔 고레벨 방사능 폐기물로 앞으로 나아가지 못하고 오즈자매와 싸우게 된다. 강력한 특수능력을 가지고 있는 오즈자매를 당해내지 못한 나루세 일행은 도주하게 되는데…

심각한 부상을 입은 나루세는 플래닛으로 옴겨져 하루토의 피를 수혈받는다. 나루세 일행은 제1사단을 피해 자위대의 구조만을 기다리지만 국제회의로 인해 구조는 늦어만지고 이부키의 출산이 얼마남지 않아 나루세 일행은 구 수도 중심지에 있는 병원으로 향하게 되는데…

플래닛으로 쳐들어온 제1사단은 아오이를 납치한다. 아오이를 구출하기 위해 나루세는 제1사단 기지로 침입하지만 궁지에 몰리게 되고 한편 미시마 교감의 명령에 의해 보건계를 지원하게된 하루토는 위기에 처한 나루세를 구출한다…

구조활동을 계속하던 코펠리온은 누군가에게 공격당한 자동차에서 임산부와 그녀의 아버지를 만나게 되고, 망령이라 불리는 제1사단에게 쫓기게 된다. 도망치던중 타에코가 총에 맞게되고 다친 타에코와 임산부의 안전을 위해 JASA본부로 가게되는데…

스텔스기의 추격을 시작한 코펠리온은 아오이가 찾아낸 방공무기로 스텔스기를 격퇴한다. 격추당한 스텔스기가 불시착한 곳은 위험 지역으로 그곳은 고레벨에 방사능 폐기물과 그 처리를 전문으로하는 업체 '옐로우 케익'의 폐기물 처리장이 되어있었다. 그 사실에 이바라와 동료들은 분노하게 되고 무전을 들은 시바 박사는 갑자기 사라지는데…

미시마 교감은 코펠리온이 구출한 생존자에 의해 리더 격으로 예상되는 '배달부'의 존재를 알게 된다. 코펠리온은 늑대가 물고 온 자동차 열쇠로 인해 배달부와 만나게 되고 그들로부터 구 수도 생활의 실태를 듣는다. 마지막 남은 생존자, 아야메 할머니를 구출하기 위해 코펠리온은 다시 출발하고 한편 미시마 교감은 과학반 무샤노 코우지에게서 배달부의 정체를 듣게 되는데…

코펠리온은 방사능으로 사람이 살 수 없는 이 곳 도쿄에서 생활하고 있는 생존자와 만나게 된다. 그들에게 어떻게 생존할 수 있었는지 이야기를 듣게되고 행방불명인 그들의 딸 미쿠를 찾기위해 조사에 나선다. 과연 그들을 위해 식량을 배급한 트럭은 누구이며 미쿠의 행방은 찾을수 있는 것일까…

때는 서기 20XX년 방사능에 의해 사람이 살지 못하는 도쿄시내에 3명의 소녀가 생존자의 SOS신호를 받고 구조에 나섰다. 이들의 이름은 코펠리온! 오염된 도시에서 방호복없이 생존할 수 있는 유일한 인간이다. 폐허가 된 도쿄시내에 과연 무슨일이 벌어지고 있는 것일까…